מערכת השעות בישיבה מחולקת לשני חלקים – לימודי הקודש ולימודי התיכון
לימודי הקודש
בחלק הראשון של היום לומדים התלמידים גמרא, קצב הלימוד נע בין דף לדף וחצי ליום. הלימוד הוא מגוון כך שבתחילת היום יש שיעור פרונטלי בכיתה עם הר״מ על דפי הגמרא הנלמדים, ובהמשך גם חזרה על הנלמד בחברותות בבית המדרש.
דרך לימוד זו מאפשרת למידה של הגמרא מפי הר״מ יחד עם פיתוח עצמאות בלימוד הגמרא ונתינת זמן ומקום משמעותי לחזרות על הגמרא.
לימודי תיכון
בחלק השני של היום לומדים התלמידים את לימודי התיכון לבגרות, בשילוב שיעוריו של ראש הישיבה ושיעורי העשרה שונים, מצורפת מערכת שעות לדוגמא:
